Conception graphique : Seyabec inc. Illustrations gracieusetés de Georges Le Gouhaler (Montreal Neurological Institute) pour le cerveau, |
L'année 2000-2001 au CRM est consacrée au domaine en pleine ébullition des méthodes mathématiques en biologie et en médecine. L'emploi des mathématiques aide à la compréhension des phénomènes naturels par la modélisation, l'analyse et le développement de méthodes d'inférence. Les activités couvrent ces trois aspects, par des ateliers traitant de diverses applications de la dynamique nonlinéaire à la biologie et à la médecine, de génomique et d'imagerie médicale. |
Table des matières |
En collaboration avec le "Centre de dynamique nonlinéaire en biologie et en médecine", une solide introduction aux applications de la dynamique nonlinéaire en biologie et en médecine, avec exercices sur ordinateurs et présentations de méthodes numériques.
Organisateur : Jacques Bélair (Montréal)
Enseignants : M. Courtemanche (Montréal), E. Doedel (Concordia), L. Glass (McGill), M. Guevara (McGill), A. Longtin (Ottawa), M. C. Mackey (McGill), J. Milton (Chicago), A. Vinet (Montréal), J. Bélair (Montréal)
Réunion de biologie computationnelle regroupant les domaines partageants un intérêt commun de formulation, reconnaissance algorithmique, analyse, communication et mémorisation de patrons dans diverses formes de données.
Organisateurs : Raffaele Giancarlo (University of Palermo), David Sankoff (Montréal)
Conférenciers invités : A. Broder (Altavista), F. Pereira (AT&T Labs), I. Witten (Waikato, New Zealand)
La plus importante réunion annuelle en biologie moléculaire computationnelle, présentant un choix relevé des meilleures communications sur les projets les plus actuels, couvrant les aspects tant mathématiques que computationnels.
Organisateur local : David Sankoff (Montréal)
Pour plus d'informationsDivers aspects de la bioinformatique seront abordés dans cet atelier présenté dans le cadre du congrès annuel de l'Association canadienne-française pour l'avancement des sciences (ACFAS).
Organisateur : Nadia El-Mabrouk (Montréal)
Conférenciers invités : G. Butler (Concordia), G. Drouin (Ottawa), D. Forsdyke (Queen's), A. Kusalik (Saskatoon), M. Li (Waterloo), P. Rouzé (Ghent)
Ce symposium permettra de faire le point sur l'état actuel en informatique de l'ARN, et d'en entrevoir les développements futurs. Ce symposium offrira un lieu d'échange pour essaimer les percées les plus récentes, et rassemblera des scientifiques oeuvrant en biochimie, biologie moléculaire, informatique, mathématiques et statistiques qui présenteront un aperçu des approches nouvelles.
Organisateur : François Major (Montréal)
Conférenciers invités : C. Duarte (Columbia), A. Ellington (*) (Texas), R. Hughey (*) (UCSC), V. Mohan (Isis), E. Rivas (Washington), B. Shapiro (NCI), C. Wilson (UCSC)
(*) à confirmer
La modélisation dans ce domaine a récemment abordé des sujets comme la régulation de la progression dans le cycle cellulaire contrôlée ponctuellement, le contrôle des "lactose operon" et "tryptophan operon", et le comportement global de grands réseaux moléculaires, métaboliques ou génétiques. Cet atelier rassemble des expérimentateurs et des modélisateurs pour faire le point sur l'état actuel du domaine et entrevoir les perspectives de développements futurs.
Organisateur : Michael C. Mackey (McGill)
Conférenciers invités : D. Bray (Cambridge), J. Collins (Boston), G. Church (Harvard), I. Epstein (Brandeis), J. Ferrell (*) (Stanford), L. Glass (McGill), A. Goldbeter (UL Bruxelles), H. Herzel (Berlin), K. Kohn (NIH), R. Larter (Purdue), S. Leibler (*) (Princeton), J. Mahaffy (San Diego State), J. Reinitz (Mt. Sinaï), J. Ross (Stanford), M. Roussel (Lethbridge), M. Santillan (Mexico City), M. Savageau (Michigan), S. Scott (Leeds), K. Showalter (West Virginia), P. Smolen (*) (Houston), R. Somogyi (Incyte), D. Thieffry (ULB), J. Tyson (Virginia), D. Wolf (Lawrence Livermore)
(*) à confirmer
Inscription
Dynamique de l'ordre génique, cartographie comparative et
familles multigéniques
22-25 septembre 2000
(Le Chanteclerc, Ste-Adèle, Québec)
Cette rencontre réunira des chercheurs des sciences biologiques et mathématiques travaillant sur les problèmes liés au réarrangement génique, à la cartographie et à l'évolution de familles de gènes chez l'humain, l'animal, les plantes et autres génomes eukaryotes, prokaryotes, d'organelles et viraux.
Organisateurs : David Sankoff (Montréal), Joseph H. Nadeau (Case Western Reserve University)
Conférenciers invités : S. Anderson (Uppsala), V. Barriel (Paris) & C. Gallut (Paris), B. Bed'Hom (Paris), M. Blanchette (Seattle), J. Boore (Michigan), P. Bork (Heidelberg), D. Bryant (Montréal), G. Burger (Montréal), A. Caprara (Bologna) & G. Lancia (Padua), O. Cohen (Grenoble), K. Devos (UK), E. Eichler (Case Western Reserve), N. El-Mabrouk (Montréal), V. Ferretti (Montréal), A. Hughes, R. Irving (Glasgow), H.-P. Klenk (Gottingen), B. Koop (Victoria), D. Liben-Nowell (Cornell), L.A. Lyons (NIH), S.R. McCouch (Cornell), A. McLysaght (Dublin), S.M. McPeek (Chicago), J. Meidanis (Sao Paolo), A. Paterson (Georgia), J. Postlethwait (Oregon), D. Schoen (McGill), R. Shamir & I. Pe'er (Tel Aviv), M. Turmel (Laval), B. Trask (Seattle), D. Waddington (UK), J. Womack (Texas A&M)
Toute personne intéressé à participer à cette activité doit écrire à David Sanfoff.
Le point sera fait sur les applications des techniques de la dynamique nonlinéaire en biologie, notamment la biochimie, la physiologie, la gestion des ressources renouvelables et l'imagerie médicale. Cet atelier se tient dans le cadre des Entretiens du Centre Jacques-Cartier.
Organisateurs : Pierre Auger (Lyon), Jacques Bélair (Montréal), Jacques Demongeot (Grenoble), Christiane Rousseau (Montréal)
Conférenciers invités : O. Arino (Pau), P. Auger (Lyon), H. Benali (CHU Pitié Salpêtrière), A. Bourdou (INSERM), R. Bravo de la Parra (Alacala), F. Clarke (Lyon), J.-L. Coatrieux, J. Demongeot (Grenoble), A. Goldbeter (UL Bruxelles), R. Roussarie (Dijon), R. Thomas (UL Bruxelles), P. Tracqui (Grenoble), J. Bélair (Montréal), L. Gagnon (CRIM), L. Glass (McGill), B. Goulard (Montréal), J.-M. Lina (Montréal), S. Lessard (Montréal), A. Longtin (Ottawa), A. Vinet (Hôpital du Sacré-Coeur), N. Raissi (Maroc), D. Salahub (Institut Steacie), G. Wolkowicz (McMaster)
Il y aura une version de posters. Si vous voulez présenter un poster, veuillez soumettre le titre à Christiane Rousseau
Inscription
Cet atelier portera sur les progrès récents dans la modélisation mathématique de systèmes neuronaux comportant une ou plusieurs des caractéristiques importantes suivantes: 1) mémoire - et mémoire "dynamique" tout particulièrement, 2) délais synaptiques et de propagation, ou 3) coexistence d'états asymptotiques. Ces caractéristiques, ainsi que leurs interactions possibles, ont été souslignées dans un bon nombre d'études récentes dans une multitude de domaines, notamment dans le contexte de l'activité neuronale des circuits récurrents omniprésents dans le système nerveux. L'emphase sera mise surtout sur la modélisation de systèmes biologiques réels; cependant, l'atelier explorera également la pertinence de ces problèmes pour une gamme de disciplines allant de la psychologie aux réseaux neuronaux artificiels.
Organisateur : André Longtin (Ottawa)
Conférenciers invités : K. Aihara (Tokyo), S. Becker (McMaster), S.A. Campbell (Waterloo), C. Canavier (New Orleans), G. Carpenter (Boston), A. Destexhe (CRNS, Gif-sur-Yvette, France), M. Ding (Florida Atlantic), R. Engbert (Postdam), U. Ernst (Bremen), R. Hahnloser (MIT), W. Gerstner (Lausanne), L. Glass (McGill), S.K. Han (Chungbuk, Corée du Sud), A. Herz (Humboldt-Berlin), E. Izhikevich (The Neurosciences Inst.), C. Laing (Pittsburg), W. Maass (Tech. U. Graz), J. Milton (Chicago), K. Pakdaman (INSERM), H. Wilson (York), J. Wu (York)
(*) à confirmer
Inscription
Cet atelier rassemblera des mathématiciens, des expérimentateurs, des cliniciens et des industriels qui exposeront et discuteront diverses approches pour la cartographie et le contrôle des arythmies complexes. Une attention particulière sera portée à une approche multidisciplinaire du contrôle de la fibrillation auriculaire.
Organisateur : Leon Glass (McGill)
Conférenciers invités : M. Allessie (*) (Holland), D. Christini (New York), J. Collins (Boston), W. Ditto (*) (Georgia), A. Garfinkel (Los Angeles), P. Guerra (*) (Montréal), R. Ideker (Alabama), J. Jalife (*) (Syracuse), A. Karma (Boston), V. Krinsky (Nice), J. Leon (*) (Montréal), M. Lesh (San Francisco), R. Mehra (*) (Minneapolis), D. Nahon (*) (Montréal), S. Nattel (*) (Montréal), A. Panfilov (Holland), Y. Rudy (Cleveland), N. Trayanova (New Orleans), A. Vinet (Montréal), A. Winfree (*) (Arizona)
(*) à confirmer
Commandité par Guidant Corporation
Inscription
Des problèmes classiques en sciences des matériaux (caractérisation de surfaces, description d'arborescence) ont connu un essor nouveau sous l'éclairage de la géométrie fractale. Cet atelier traitera des développements théoriques les plus récents, leurs implémentations dans le domaine biomédical et les directions de recherches les plus prometteuses.
Organisateurs : Jacques Bélair (Montréal), Fahima Nekka (Montréal)
Conférenciers invités : Q. Cheng (York), A. Einstein (Mt. Sinaï), B.H. Kaye (Laurentian), S. Lubkin (North Carolina), H.E. Stanley (Boston), C. Tricot (Clermont-Ferrand), E. Vrscay (Waterloo), G. West (*) (Los Alamos)
(*) à confirmer
Pour de plus amples informationsInscription
La cartographie cérébrale est un domaine en pleine croissance qui cherche à cerner l'anatomie et la physiologie du cerveau humain à partir des images tridimensionnelles obtenues par des techniques de MRI, fMRI, PET, EEG ou EMG, par des méthodes gémétriques, topologiques et statistiques. Cet atelier rassemblera des mathématiciens et des statisticiens intéressés par ce domaine, et des chercheurs médicaux intéréssés aux méthodes mathématiques et statistiques d'analyse des données cartographiques cérébrales.
Organisateur : Keith Worsley (McGill)
Conférenciers invités : J. Ashburner (UCL), J. Aston (London), H. Benali (CHU Pitié Salpêtrière), E. Brown (Harvard), A. Dale (Harvard), K. Friston (UCL), G. Glover (Stanford), L. K. Hansen (Tech. U. Denmark) , N. V. Hartvig (Aarhus), M. Hurdal (Florida State University), S. Kiebel (FSU jena), J.-F. Mangin (Service Hospitalier Frédéric Joliot, Orsay), J. Raz (U. Penn.), J. Riera (Cuban Neuroscience Center), J. Taylor (McGill), P. Thompson (UCLA)
Pour de plus amples informationsInscription
Organisateur : Jean-Marc Lina (Montréal)
Inscription
Les gènes et les allèlles de la génétique classique sont des notions abstraites. Puisqu'ils sont maintenant de plus en plus interprétés comme suites d'ADN et de protéines, les fondements mathématiques du domaine doivent être revus, ce qui est le but de cet atelier.
Organisateur : Brian Golding (McMaster)
Conférenciers invités : M. Gouy (Lyon), J. Huelsenbeck (Rochester), S. Kumar (Arizona State), S. Muse (NCSU), B. Rannala (Stony Brook), A. Rzhetsky (Columbia), J. Thorne (NCSU), Z. Yang (U.C.London)
Inscription
Ce symposium fera le point sur les connaissances actuelles de la structure computationnelle de l'ARN et explorera les voies d'avenir du domaine.
Organisateur : François Major (Montréal)
Conférenciers invités : R. Altman (Stanford), J. Brown (NCSU), D. Case (Scripps), D. Gautheret (CNRS-Marseille), R. Gutell (Texas), S. Harvey (Alabama), D. Haussler (*), E. Westhof (CNRS-Strasbourg), M. Zuker (*) (St. Louis)
(*) à confirmer
InscriptionPrécédant CPM2000, une introduction de deux jours sur l'analyse des suites et sujets connexes en biologie computationnelle et agencement.
Organisateur : David Sankoff (Montréal)
Conférenciers invités : D. Bryant (Montréal), N. El-Mabrouk (Montréal), I. Witten (Waikato, New Zealand) et d'autres
Un parmi une série d'ateliers de nature pédagogique sous l'égide du Réseau canadien des maladies génétiques et du Conseil des ressources humaines en biotechnologie.
Organisateurs : Christopher Hogue (Toronto), François Major (Montréal)
Précédant l'atelier sur les réseaux moléculaires, métaboliques et de contrôle génétique, ce cours présentera les concepts de base et les techniques de modélisation biochimique.
Conférenciers invités : R. Larter (Purdue), S. Scott (Leeds), K. Shoewalter (West Virginia)
En préparation de l'atelier sur la cartographie cérébrale, quatre séries de cours seront offertes, traitant de la géométrie des champs aléatoires et des méthodes mathématiques en analyse des électro-encéphalogrammes (EEG) et de la résonance magnétique fonctionnelle (fMRI).
Organisateurs : Keith Worsley (McGill), Bernard Goulard (Montréal)
Conférenciers invités : R. Adler (TECHNION), H. Benali (CHU Pitié Salpêtrière), N. Lange (Harvard), P. Valdes (Cuban Neuroscience Center)
Pour de plus amples informations
Précédant l'atelier du même titre, ce cours introduira le sujet aux non spécialistes.
Organisateurs : Jean-Marc Lina (Montréal), Fahima Nekka (Montréal)
Conférencier invité : M. Unser (Swiss Federal Institute of Technology, Lausanne)
Ce séminaire s'adresse aux chercheurs et étudiants intéressés à l'état actuel de l'analyse phylogénétique. Les conférenciers couvriront chacun un ou deux sujets importants, et laisseront ample part aux discussions, comparaisons et échanges. Parmi les thèmes abordés: méthodes efficaces pour de très grandes phylogénies, approches avec ou sans modèle, inférence d'arbre avec et sans reconstruction ancestrale, généralisations d'arbres. Des progiciels seront disponibles pour démonstrations et accès interactif.
Organisateurs : David Bryant (Montpellier), David Sankoff (Montréal)
Conférenciers invités : D. Bryant (Montréal), A. Dress (Bielefeld), J. Felsenstein (Seattle), O. Gascuel (Montpellier), T. Hagedorn (College of New Jersey), K. Nixon (Cornell), M. Steel (Canterbury), D. Swofford (Cornell), T. Warnow
Un soutien financier est disponible pour des visites de durée variable (de quelques jours à toute l'année), préférablement à des chercheurs en début de carrière.
Jacques Bélair (Montréal)
Leon Glass (McGill)
Brian Golding (McMaster)
Leah Keshet (UBC)
David Sankoff (Montréal)
Keith Worsley (McGill)
Tous ceux intéressés à participer à ces activités sont invités à écrire à :
Louis Pelletier
Centre de recherches mathématiques (CRM)
Université de Montréal
C.P. 6128, Succ. Centre-ville
Montréal (Québec), CANADA H3C 3J7
Adresse électronique : ACTIVITES@CRM.UMontreal.CA
9 août 2001, webmestre@CRM.UMontreal.CA